文件名称:TCW:单个和比较转录组的分析
文件大小:9.81MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-14 20:03:12
transcriptome differential-gene-expression comparative-transcriptomes Java
或下载TCW软件包: AGCoL站点可能具有较新的版本(请参见)。 文档: 参考: C.Soderlund(2019)转录组计算工作台(TCW):单个和比较转录组的分析。 发表于 。 描述:对于单转录组(singleTCW)-针对注释数据库,GO注释,ORF查找和差异分析的相似性搜索。 对于多转录组(multiTCW)-计算相似的对,提供对的统计信息,计算聚类,提供聚类的统计信息。 singleTCW和multiTCW都提供图形界面,用于广泛的查询和结果显示。 要求: Java和MySQL构建数据库并查看结果。 R用于差异分析。 TCW使用的所有其他外部软件都包含在tar文件包中。 TCW软件包:要使用TCW,请从顶部的链接下载TCW软件包。 tar文件包含所有必需的jar文件,R脚本和演示文件。 按照的说明进行操作。 TCW github代码:此站点不包括外部软件包; 您将