文件名称：dozeu:序列图上的SIMD并行BLAST X-drop DP
文件大小：84KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-15 03:13:29
C
dozeu.h SIMD并行BLAST X-drop对齐实现。 （工作正在进行中...） 特征 BLAST X-drop DP算法（）； 预期对大多数用例足够敏感 使用SSE4.1矢量化（在Core2（2007）或更高版本上运行；每个单元使用16位带符号的int） 线到图对齐（首先为子命令开发；的方法） 仅标头且与C ++兼容 例子 /* * * Aligning ACACTTCTAGACTTTACCACTA to the following graph * 6 * A * 0 1 3 5 /7\9 * ACAC-TTGT-AGAC---TTCTA-C-CACTA * \ / \ / \ / * AT
【文件预览】：
dozeu-master
----unittest.h(36KB)
----Makefile(576B)
----example.protein.c(7KB)
----example.c(3KB)
----fig()
--------xdrop.png(48KB)
----README.md(10KB)
----dozeu.h(67KB)
----log.h(3KB)
----example.2bit.c(4KB)