RASflow:RNA-Seq分析工作流程

时间:2024-05-18 16:47:02
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更新时间:2024-05-18 16:47:02

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RASflow:RNA-Seq分析Snakemake工作流程 RASflow是一种模块化,灵活且用户友好的RNA-Seq分析工作流程。 RASflow可以应用于模型生物和非模型生物。 它支持将RNA-Seq原始读物映射到基因组和转录组(可以从公共数据库下载或由用户自制),并且在使用转录组作图时可以进行转录水平和基因水平的差异表达分析(DEA)。参考。 基本用途只需要很少的编程技能。 如果您擅长编程,则可以使用RASflow做更多的魔术! 您可以通过引用我们的出版物来帮助支持RASflow: Zhang,X.,Jonassen,I. RASflow:使用Snakemake的RNA-Seq分析工作流程。 BMC Bioinformatics 21,110(2020)。 工作流程 快速开始 安装 克隆存储库: git clone https://github.com/zhxiaokan


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