文件名称：cfDNA:cfDNA分析工作流程
文件大小：8.13MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-09 11:27:00
Python
Snakemake工作流程：通过无细胞DNA片段化模式捕获的表观遗传信号分析 该存储库包含snakemake工作流程，用于分析无细胞DNA片段化模式捕获的表观遗传信号。 以下分析基于以下出版物： Snyder MW，Kircher M，Hill AJ，Daza RM，ShendureJ。无细胞DNA包含体内核小体足迹，该信息通知了其来源组织。 细胞。 2016年1月14日; 164（1-2）：57-68。 doi：10.1016 / j.cell.2015.11.050。 考研PMID： 有关此分析的更多详细。 所有脚本和二进制文件均按原样提供，没有任何担保，使用后果自负。 这不是发行的软件包。 我们仅提供此信息和代码，并仅提供使方法易于重现分析的方法的描述。 我们不为这些脚本提供任何支持。 目录 工作流程 窗口保护得分叠加 描述 输入 输出 基因表达分析 描述 输入 输出
【文件预览】：
cfDNA-master
----.gitattributes(66B)
----workflow()
--------envs()
--------scripts()
--------schemas()
----snakefile_WPS.smk(8KB)
----config()
--------README.md(3KB)
--------regions.tsv(58B)
--------example.config.yml(1KB)
--------samples.tsv(288B)
----LICENSE(1KB)
----README.md(10KB)
----resources()
--------blacklists()
--------protein_atlas()
--------genome()
--------README.md(1KB)
--------annotations()
----.editorconfig(249B)
----.gitignore(511B)
----CHANGELOG.md(1KB)
----snakefile_GE_analysis.smk(7KB)