poreminion:用于分析牛津纳米KongminION数据的其他工具

时间:2024-06-08 18:54:43
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文件名称:poreminion:用于分析牛津纳米KongminION数据的其他工具

文件大小:57KB

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更新时间:2024-06-08 18:54:43

Python

毛Kong收缩-0.4.4(2015年7月24日) John Urban分析牛津纳米KongminION数据的其他工具。 工具: uncalled Find Fast5 files that were not base-called. timetest Find Fast5 files that have event times that are earlier than event times before it suggesting malfunction/erroneous read. fragstats Run this on set of base-called fast5 files. Returns tab-delimited table with columns:


【文件预览】:
poreminion-master
----LICENSE.txt(1KB)
----requirements.txt(74B)
----poreminion()
--------findUncalled.py(5KB)
--------kmerplot.py(4KB)
--------findTimeErrors.py(2KB)
--------dataconc.py(7KB)
--------kmer.py(3KB)
--------numevents.py(708B)
--------robust.py(8KB)
--------has2D.py(429B)
--------events_tools_pm.py(7KB)
--------info.py(6KB)
--------pct2D.py(301B)
--------scripts()
--------staypos.py(691B)
--------__init__.py(102B)
--------hdf_fxns.py(5KB)
--------get_events.py(2KB)
--------winner.py(3KB)
--------basecalldissection.py(1KB)
--------qual_v_pos.py(5KB)
--------kmerdiff.py(9KB)
--------qualdist.py(670B)
--------version.py(21B)
--------quadparsersuite.py(8KB)
--------seqlen.py(418B)
--------nX.py(2KB)
--------fragstats.py(18KB)
--------fragsummary.py(64KB)
--------poreminion_main.py(58KB)
----setup.py(2KB)
----README.md(10KB)
----change-log.txt(4KB)

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