文件名称：PyPore:用于分析基于纳米Kong的实验数据的工具
文件大小：405KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-17 09:42:10
Python
Kong 纳米Kong数据分析 PyPore 包基于一些核心数据分析包，以便为处理 UCSC 纳米Kong实验室中的纳米Kong数据提供一致且简单的框架。 它需要的包是： 麻木的 scipy matplotlib 学习 不需要但可以使用的软件包是： 数据库 赛通 PyQt4 让我们开始吧！ 数据类型 为了加速分析，实现了几种核心数据类型。 这些当前是文件、事件和段。 其中每一种都是存储完整或部分 .abf 文件并执行常见任务的方法。 文件 属性：持续时间、平均值、标准、最小值、最大值、n （# 个事件） 、秒、当前、样本、事件、event_parser、文件名 实例方法：parse(parser),delete(),to_meta(),to_json(filename),to_dict(),to_database(database,host,user,password),plot
【文件预览】：
PyPore-master
----setup.py(1KB)
----PyPore()
--------DataTypes.py(43KB)
--------cparsers.pyx(9KB)
--------__init__.py(308B)
--------hmm.py(25KB)
--------database.py(10KB)
--------alignment.py(29KB)
--------parsers.py(29KB)
--------read_abf.py(7KB)
--------calignment.pyx(4KB)
--------core.py(7KB)
----LICENSE.txt(1KB)
----examples()
--------PyPore Tutorial.ipynb(503KB)
----README.md(25KB)
----CHANGES.txt(31B)
----MANIFEST(238B)