文件名称:nanostat:创建牛津纳米Kong读取数据集的统计摘要
文件大小:19KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-18 09:00:50
Python
NanoStat 从 fastq、bam 或 albacore 测序摘要格式的长读测序数据集中计算各种统计数据。 安装 NanoStat 是为 Python3 编写的,不适用于 Python2.7 或更早版本。 pip install nanostat 或者conda install -c bioconda nanostat 用法 NanoStat [-h] [-v] [-o OUTDIR] [-p PREFIX] [-n NAME] [-t N] [--barcoded] [--readtype {1D,2D,1D2}] (--fastq file [file ...] | --fasta file [file ...] | --summary file [file ...] | --bam file [file .
【文件预览】:
nanostat-master
----setup.py(1KB)
----.gitignore(76B)
----__init__.py(57B)
----.travis.yml(334B)
----MANIFEST.in(42B)
----LICENSE(34KB)
----setup.cfg(29B)
----scripts()
--------test.sh(350B)
----README.md(4KB)
----nanostat()
--------__init__.py(33B)
--------version.py(22B)
--------NanoStat.py(8KB)