psi:泛基因组种子指数

时间:2024-04-29 23:17:52
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文件名称:psi:泛基因组种子指数

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更新时间:2024-04-29 23:17:52

C++

PSI-泛基因组种子指数 这是在以下方法中引入的方法的实现: Ghaffaari,A。&马绍尔,使用混合指数生物信息学,2019年,35,T。综敏感种子发现在序列图表I81-I89 如何安装 依存关系 最低要求 PSI使用C ++ 17中引入的许多功能。 为了使用它,您首先需要一个符合C ++ 17的编译器。 已针对以下编译器进行了测试: 编译器 版本 海湾合作委员会 8.3、9.2、10.2.0 PSI是仅标头的库。 但是,它取决于一些外部库的工作: CMake> = 3.10 Zlib BZip2 捆绑依赖 PSI捆绑了更多的依赖项。 即PSI可以为您安装它们。 如果希望PSI这样做,请在运行cmake时指定-DUSE_BUNDLED_ALL=on (稍后说明)。 这些依赖项是: SeqAn 2.4.0版 GUM版本0.1.1 kseq ++,版本0.2.3 Pair


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