matlab代码cox-scTenifoldNet:AR/MATLAB软件包,用于从单细胞转录组数据构建和比较基因调控网络

时间:2024-06-12 14:26:27
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文件名称:matlab代码cox-scTenifoldNet:AR/MATLAB软件包,用于从单细胞转录组数据构建和比较基因调控网络

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更新时间:2024-06-12 14:26:27

系统开源

Matlab代码考克斯scTenifoldNet AR / MATLAB程序包使用基于机器学习方法从不同条件收集的单细胞RNA-seq(scRNA-seq)数据来构建和比较单细胞基因调控网络(scGRN)。 scTenifoldNet使用主成分回归,张量分解和流形比对来准确识别甚至微妙转移的基因表达程序。 安装: scTenifoldNet可通过CRAN存储库获得,您可以使用以下命令安装scTenifoldNet : install.packages('scTenifoldNet') library(scTenifoldNet) 或者,如果您对开发中的版本感兴趣,则可以使用以下命令安装scTenifoldNet : library(remotes) install_github('cailab-tamu/scTenifoldNet') library(scTenifoldNet) 可用功能: 代码 功能 质量控制 执行单细胞数据质量控制 cpmNormalization 执行百万计数(CPM)数据归一化 网络 根据主成分回归计算基因调控网络 makeNetworks 基于主成分回归计算


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