文件名称:jenome:玩弄人类基因组和Clojure
文件大小:2.84MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-26 04:27:46
Clojure
杰诺姆
“ DNA是宇宙中最复杂的机器的源代码。” -兰德尔·芒罗(Randall Munroe),“如果呢?”
用于处理人类或其他基因组数据的代码。
有关更多详细信息,请参阅我在博客文章。
测验
lein spec # add `-a` to automatically retest after updating code.
处理一个.2bit基因组文件(在stdout中转换为类似FASTA的纯文本):
首先,从下载一些.2bit基因组代码。 或者,使用resources/sacCer3.2bit 。
然后,
lein run
【文件预览】:
jenome-master
----.gitignore(171B)
----README.md(1KB)
----resources()
--------sacCer3.2bit(2.9MB)
----project.clj(400B)
----src()
--------jenome()
----spec()
--------jenome()