Triti-Map:基于Snakemake的黑麦基因定位管道

【文件属性】：
文件名称：Triti-Map:基于Snakemake的黑麦基因定位管道
文件大小：82KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-04-12 11:02:48
bioinformatics snakemake genomics epigenetics variant-analysis Triti-Map是用于Triticeae中基因定位的基于Snakemake的管道，其中包含一组用户友好的计算包和，集成了Triticeae物种的多组学数据，包括基因组，表观基因组，进化和同源信息。 Triti-Map可以有效地探索参考基因组中不存在的与性状相关的基因或功​​能元件，并减少大型基因组物种中进行基因作图所需的时间和精力。 中提供了更详尽的信息和说明。 Triti-Map工作流程概述 Triti-Map优化步骤以应对Triticeae基因映射的特定挑战 Triti-Map入门 安装 从Bioconda安装 首先，要安装Triti-Map，您需要一个包含的UNIX环境。 了解如何安装Conda # create new environment and install Triti-Map conda create -c conda-forge -c bioconda -n

【文件预览】：
Triti-Map-main
----setup.py(1KB)
----.gitignore(209B)
----Dockerfile(189B)
----MANIFEST.in(29B)
----LICENSE(1KB)
----tritimap_env.yaml(509B)
----.github()
--------ISSUE_TEMPLATE()
----README.md(8KB)
----tritimap()
--------Snakefile(14KB)
--------tritimap.py(5KB)
--------__init__.py(88B)
--------schemas()
--------sample.csv(226B)
--------region.csv(42B)
--------scripts()
--------rules()
--------config.yaml(3KB)
----docs()
--------manual.md(33KB)
--------manual_zh.md(31KB)