metabolizer:用于在代谢途径中分析转录组(和突变)数据的网络工具

时间:2024-05-18 20:32:07
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文件名称:metabolizer:用于在代谢途径中分析转录组(和突变)数据的网络工具

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更新时间:2024-05-18 20:32:07

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代谢者 在这里,您可以找到Metabolizer工具的R脚本以及其用法的一些玩具示例。 除此R代码外,您还可以使用Metabolizer网络服务器执行代谢模块活动的分析,为: : 在这里,您可以找到大约的路径模块。 3400种生物已准备好通过Metabolizer进行分析。 org是生物体的代码。 检查生物列表/sharedData/KEGG_organism_codes.txt未对从KEGG中删除的生物进行建模。 删除的KEGG生物: : 对于每种生物,您将发现: org_module_data_April2019.RData (图形格式的模块;此文件是分析所必需的,并由metabolizer函数通过moduleinfo参数使用。请检查 ) org_geneIDs.RData (用于基因ID转换;此文件对于分析是必需的) org_KEGG_module_and_pa


【文件预览】:
metabolizer-develop
----metabolizer-web-master()
--------.gitignore(70B)
--------images()
--------package.json(463B)
--------src()
--------metabolizer_logo.png(98KB)
--------build.js(2KB)
--------LICENSE.txt(34KB)
--------README.md(310B)
--------metabolizer-element.html(23KB)
--------favicon.ico(1KB)
--------conf()
--------bower.json(524B)
--------metabolizer-index.html(3KB)
----README.md(2KB)
----metabolizer.git()
--------data.tar.gz(3.88MB)
--------script()

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