MUFFIN:用于宏基因组学,转录组学和途径分析的混合装配和差异分箱工作流程

时间:2024-06-11 13:50:20
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文件名称:MUFFIN:用于宏基因组学,转录组学和途径分析的混合装配和差异分箱工作流程

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更新时间:2024-06-11 13:50:20

Nextflow

松饼 MUFFIN是混合装配和差分装箱工作流程,用于宏基因组学,转录组学和途径分析。 如果您在研究中使用MUFFIN,请引用 该文档位于 指数 : : 用法: 自动使用 基本用法 进阶用法 故障排除 选项 完整的帮助和选项 参考书目 执照 介绍 MUFFIN的目标是成为交叉照明和纳米Kong读数的元基因组组装的可复制管道。 MUFFIN使用以下软件 任务 软件 版本 码头工人 图片版本 QC照明 快 0.20.0 关联 0.20.0--78a7c63 质量控制 自动丢弃最短读取的方法 弗朗特朗 0.2.0 关联 v0.2.0--afa175e 元的宏基因组组成 酸味 2.0.1 关联 2.0.1--6970ddc 混合组件 元铲 3.13.1 关联 3.13.1--2c2a4c0 独轮车 0.4.7 关联 0.4.7-0--c0404e6 长时间阅读组装 Me


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MUFFIN-master
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--------pankegg_bin.py(24KB)
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--------checkm_sourmash_parser.nf(754B)
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