文件名称：poreqc:poreQC纳米Kong测序实验报告
文件大小：39KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-23 15:18:30
Python
#poreQC v0.2.10 poreQC纳米Kong测序实验报告 根据牛津纳米KongMinION实验的中间或最终输出数据生成PDF报告。 输入： 样品，文库和测序元数据文件 包含基本调用和/或预基本调用的.fast5文件的目录 输出： report.pdf：统计和诊断图的可打印报告 readstats.txt：来自MinION的事件统计信息（TSV格式） callstats.txt：Metrichor返回的基本呼叫的统计信息（TSV格式） table.txt：运行的摘要统计信息（可读文本） table.csv：运行摘要统计信息（TSV格式） 笔记： 该程序设计为在将原始测序数据从测序笔记本电脑同步到服务器后运行，该服务器可以处理数据而不会影响控制测序实验的计算机。 特殊的“数据状态文件”将指示运行是否已完成或仍在进行中。 usage: poreqc.py [-
【文件预览】：
poreqc-master
----poreqc.py(84KB)
----README.md(3KB)
----poreqc_makeplots.R(65KB)
----poreqc_extractcallstats.py(32KB)
----poreqc_extractreadstats.py(25KB)
----Makefile(1KB)