晚上参考中科院上海交大清华北大等学校的模板，终于重新把博一时候没解决的问题解决了。中科院吴老师的CTeX论坛因为维护压力比较大不得不关了,查不到之前的Latex解决答案。经过一下午和一晚上的摸索，忽然明白吴老师在网页里之前和其他网友的回复中提到多看看英文的一些帮助站点。果断查了一下麻省理工给出的相关信息，找到了答案。
写书和毕业论文与写一般论文不同，一般论文出版社会给很成熟的模板，而且论文篇幅一般小于书的篇幅，不涉及结构拆分和目录问题。而书则涉及页面边距、行距，标题字体自定义，目录格式调整等问题，涉及的包更具有开放性。
比如，如果在目录中，根据需要删减或者增加条目，则可参考麻省理工下面给出的一个Faq
http://kb.mit.edu/confluence/pages/viewpage.action?pageId=3907522
更新一下github的天大PHD论文模板。这次的改动也参考了管理学院、电信学院以及一位之前毕业了的本科生同学的模板，把他们模板中正确按照研究生院要求的实现代码结合到我之前上传到的版本进行了修正。https://github.com/6gbluewind/Tjuthesis_phd_1.2-
另外，写公式可以用下面的工具 http://latex.91maths.com/
写算法表的参考：
https://blog.****.net/qq_34369618/article/details/61205638
https://blog.****.net/lwb102063/article/details/53046265
https://www.cnblogs.com/empty16/p/6222885.html
https://www.cnblogs.com/tsingke/p/5833221.html
不过看看比利时的Gilles同学的笔记，https://castel.dev/post/lecture-notes-1/ ，或者圣母大学的拓扑学，顿时觉得，视野总在拓展。