文件名称：nanopype:用于纳米Kong测序数据存档和处理的Snakemake管道
文件大小：1.03MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-30 17:32:09
docker workflow nanopore pipeline singularity
纳米级 文献资料 详细的文档和教程可在。 Nanopype是基于snakemake的管道，可提供便捷的牛津纳米Kong技术（ONT）数据处理和存储解决方案。 流水线分为处理部分（包括基本调用和对齐）以及分析部分（涵盖其他下游应用程序）。 部分提供了所有包含的工具的摘要。 首先， 一章介绍了可用的安装选项，具体取决于操作系统，可用的硬件和已经存在的环境。 纳米Kong数据分析的重复步骤包含在本地和群集使用的中。 模块部分涵盖了所有可用工具和工作流程的深入描述，以及它们各自的配置选项。 本节是管道的主要参考。 最后，对于新用户而言，本可能有助于学习管道的一般概念和用法。 为了完成本教程，包装中包含的测试读数就足够了，并且不需要单独的湿实验室实验。