文件名称：fusion-test:DNAseq 和 RNAseq 融合检测脚本-开源
文件大小：8.27MB
文件格式：GZ
更新时间：2024-07-18 12:54:49
开源软件
fusion_test.sh 是一个 shell 脚本，用于检测 DNAseq 或 RNAseq 中的融合。 它使用 chimerascan、SOAPfuse、MapSplice2、FusionMap、fusioncatcher、TopHat 和 EricScript。 chimerascan 的输出文件由 Jinja 和 Pegasus Fusion 进一步注释。 ***更新*** 注意：EricScript 使用旧版本的 Samtools。 在此处下载修改后的程序和 Samtools-0.1.19。 更正了 fusioncathcer 配置中的错误。 FusionMap 已被弃用。 它更改为 Oshell。 旧的 FusionMap 移至fusionmap.sh。 MapSplice 更新到 2.2.2。