文件名称：RNASeq-MATS-开源
文件大小：220KB
文件格式：GZ
更新时间：2024-05-17 17:33:20
开源软件
MATS是一种计算工具，可从RNA-Seq数据中检测差异性可变剪接事件。 MATS的统计模型计算出P值和错误发现率，即两个条件之间的基因同种型比率差异超过给定的用户定义阈值。 通过RNA-Seq数据，MATS可以自动检测和分析与所有主要类型的替代剪接模式相对应的替代剪接事件。 MATS处理来自配对和未配对研究设计的重复RNA-Seq数据。 可以在http://rnaseq-mats.sourceforge.net上找到更多信息。
【文件预览】：
rmats2sashimiplot_test_data
----sample_2_replicate_3.bam(19KB)
----sample_1_replicate_3.sam(144KB)
----sample_2_replicate_3.sam(145KB)
----annotation.gtf(2KB)
----sample_2_replicate_2.sam(145KB)
----sample_1_replicate_1.bam(18KB)
----sample_2_replicate_2.bam(19KB)
----SE.MATS.JC.txt(403B)
----sample_2_replicate_1.sam(145KB)
----sample_1_replicate_2.bam(18KB)
----annotation.gff3(1KB)
----sample_1_replicate_2.sam(144KB)
----sample_1_replicate_1.sam(144KB)
----sample_1_replicate_3.bam(18KB)
----sample_2_replicate_1.bam(18KB)