文件名称：sentieon-dnaseq:Sentieon DNAseq
文件大小：34KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-20 04:43:13
acceleration gatk bioinformatics-pipeline variant-calling dnaseq
已弃用。 更新的基准可在 将 GATK 生殖系管道的结果与 Sentieon 匹配 介绍 本文档描述了 Sentieon DNAseq 管道匹配不同版本的 GATK 生殖系管道的功能。 如果您有任何其他问题，请访问或通过Sentieon Inc. 的技术支持。 输入和参考 NA12878的Fastq文件是从FTP站点下载的： ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/data/NA12878/NIST_NA12878_HG001_HiSeq_300x/140127_D00360_0011_AHGV6ADXX/Project_RM8398/ Hg38 和其他数据库是从 GATK 资源包下载的。 请参见此处： : 参数 文件 法斯塔 Homo_sapiens_assembly38.fasta known_Mills Mills_and_1
【文件预览】：
sentieon-dnaseq-master
----gatk4.1.sh(10KB)
----gatk4.0.sh(10KB)
----Sentieon_match_3.8_4.0.sh(4KB)
----Sentieon_match_4.1.sh(4KB)
----README.rst(18KB)
----runtime.png(19KB)
----gatk3.8.sh(10KB)