文件名称：glmvc:使用DNA和RNAseq数据进行体细胞突变调用
文件大小：12KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-19 12:07:28
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GLMVC：使用DNA和RNAseq数据进行体细胞突变调用 传统上，体细胞突变是通过检查DNA序列来检测的。 测序技术的成熟使研究人员能够筛选整个基因组中的体细胞突变。 研究人员越来越对通过RNAseq数据鉴定体细胞突变感兴趣。 以此动机，我们评估了从RNAseq数据检测体细胞突变的实用性。 当前的体细胞突变检出工具被设计用于DNA测序数据。 为了提高RNAseq数据的性能，我们基于DNA和RNA测序数据的偏倚归纳广义线性模型开发了一种体细胞突变调用者GLMVC。 通过与MuTect和Varscan的比较，我们表明GLMVC在使用外显子组测序或RNAseq数据进行体细胞突变检测中表现更好。 GLMVC可从以下网站免费下载： : 。 引用：盛Q，赵S，李CI，谢尔Y，郭Y：从RNA高通量测序数据检测体细胞点突变的实用性。 基因组学2016，107（5）：163-169。 - 2017/
【文件预览】：
glmvc-master
----packages.config(414B)
----GLMVC.csproj(7KB)
----Program.cs(2KB)
----glmvc.win(622B)
----app.config(965B)
----.gitignore(1KB)
----glmvc.linux(443B)
----README.md(4KB)
----template()
--------glmvc.r(7KB)
----Deploy.cs(3KB)
----Properties()
--------AssemblyInfo.cs(1KB)
--------GlmvcAssembly.cs(686B)