文件名称：tfprofile:此仓库包含用于为TF ChIP seq数据生成配置文件数据集，分析它们和训练模型的脚本
文件大小：22KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-15 19:21:27
Python
tfprofile 此仓库包含用于为TF ChIP seq数据生成配置文件数据集，分析它们和训练模型的脚本。 bw_to_tfr.sh脚本获取basenji和basset示例文件，并使用8号和9号染色体作为验证和测试集为该数据集创建tfrecords的数据集。 fr_bw_to_tfr.sh在已经存在贝母预处理文件（具有床范围）的情况下运行此程序（从子采样数据创建数据集时就是这种情况）。
【文件预览】：
tfprofile-main
----loop_fr_bw_to_tfr.sh(323B)
----bw_to_tfr.sh(2KB)
----README.md(463B)
----fr_bw_to_tfr.sh(2KB)
----bin()
--------basenji_data_read.py(9KB)
--------util.py(2KB)
--------dna_io.py(7KB)
--------create_samplefile.py(2KB)
--------basenji_data_write.py(6KB)
--------genome.py(4KB)
--------basenji_data.py(31KB)