文件名称：dawgpaws:DAWGPAWS 是一种用于发现真核基因组序列中基因和转座因子位置的工具
文件大小：17.56MB
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更新时间：2024-07-17 09:58:32
Perl
DAWGPAWS 描述 DAWGPAWS 是一种用于发现真核基因组序列中基因和转座因子位置的工具。 它作为一套命令行程序分发，旨在帮助分布式注释工作组 (DAWG) 注释基因组序列重叠群。 这些程序生成注释证据的多个轨道，可以通过计算组合或手动策划来生成基因模型和丰富注释的转座子预测。 注释证据轨迹的计算可以分布在高性能计算环境中的节点上，提供可扩展性，使其成为注释全基因组序列 (PAWS) 的管道。 DAWGPAWS 可以生成的证据的灵活性使其可以应用于任何真核基因组注释工作。 特征 DAWGPAWS 为所有程序使用命令行界面。 之所以选择命令行界面，是因为计算注释过程通常会在高性能计算集群上远程执行。 由于已为所有程序编写了标准化的命令行界面，因此无需任何 Perl 知识即可使用该套件。 DAWGPAWS 目前的功能包括： FASTA 文件操作为注释管道准备序列 序列程序集中的间隙