metaeuk:MetaEuk-大规模真核宏基因组学的敏感,高通量基因发现和注释

时间:2024-06-04 17:03:47
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更新时间:2024-06-04 17:03:47

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MetaEuk-大规模真核宏基因组学的敏感,高通量基因发现和注释 MetaEuk是一种模块化工具包,旨在用于真核宏基因组重叠群中的大规模基因发现和注释。 MetaEuk结合的快速,灵敏的同源性搜索功能用动态规划过程来恢复最佳外显子集。 它减少了同一基因的多次发现中的冗余,并解决了同一链上相互矛盾的基因预测。 MetaEuk是GPLv3许可的开源软件,以C ++实现,可用于Linux和macOS。 该软件旨在在多个内核上高效运行。 出版物 安装 可通过从源代码进行编译(请参见下文)或下载来使用MetaEuk。 它要求至少具有SSE4.1指令集(通过在Linux上执行cat /proc/cpuinfo | grep sse4_1或在sysctl -a | grep machdep.cpu.features | grep SSE4.1上进行检查)的64位系统(使用uname -a | g


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