genomics:基因组生物信息学的脚本,实用程序和程序

时间:2024-05-30 12:48:07
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文件名称:genomics:基因组生物信息学的脚本,实用程序和程序

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更新时间:2024-05-30 12:48:07

Python

基因组学/ bcftbx 在曼彻斯特大学(UoM)生命科学学院(FLS)的生物信息学核心设施(BCF)中开发了NGS和与基因组学相关的生物信息学实用程序。 完整的文档可从。 概述 实用程序分为以下几大类: 处理来自SOLiD和Illumina定序器( solid2cluster , illumina2cluster )的数据 执行QC和处理NGS数据( QC-pipeline ) 设置参考数据( build-indexes ) 支持对ChIP-seq,RNA-seq和微阵列数据( ChIP-seq , RNA-seq , microarray , NGS-general )的分析 通用非生物信息学实用程序( utils ) 还有一个名为bcftbx的Python程序包,许多程序都在使用该程序包,它提供了广泛的实用程序功能。 安装 建议使用: pip install . 从*


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