文件名称：bac-genomics-scripts：细菌基因组学的脚本集合
文件大小：1015KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-02-26 11:54:11
science unix opensource bioinformatics annotation
bac-genomics-scripts：细菌基因组学的脚本集合
【文件预览】：
bac-genomics-scripts-master
----order_fastx()
--------order_fastx.pl(14KB)
--------README.md(3KB)
----po2group_stats()
--------README.md(15KB)
--------po2group_stats.pl(51KB)
--------pics()
----sample_fastx-txt()
--------README.md(5KB)
--------sample_fastx-txt.pl(14KB)
----prot_finder()
--------prot_binary_matrix.pl(12KB)
--------transpose_matrix.pl(7KB)
--------prot_finder.pl(37KB)
--------README.md(34KB)
--------prot_finder_pipe.sh(11KB)
--------binary_group_stats.pl(38KB)
----ecoli_mlst()
--------PURA.fas(162KB)
--------FUMC.fas(256KB)
--------ICD.fas(233KB)
--------GYRB.fas(171KB)
--------ecoli_mlst.pl(21KB)
--------ADK.fas(159KB)
--------README.md(5KB)
--------publicSTs.txt(192KB)
--------RECA.fas(149KB)
--------MDH.fas(149KB)
----cat_seq()
--------cat_seq.pl(3KB)
--------README.md(3KB)
----revcom_seq()
--------revcom_seq.pl(6KB)
--------README.md(3KB)
----LICENSE(34KB)
----trunc_seq()
--------README.md(5KB)
--------trunc_seq.pl(11KB)
----sam_insert-size()
--------README.md(8KB)
--------sam_insert-size.pl(28KB)
----tbl2tab()
--------example.tbl(2KB)
--------README.md(7KB)
--------tbl2tab.pl(31KB)
--------example2.tab(2KB)
----README.md(8KB)
----ncbi_ftp_download()
--------README.md(8KB)
--------ncbi_ftp_download.sh(1KB)
--------ncbi_ftp_concat_unpack.pl(21KB)
----cds_extractor()
--------README.md(9KB)
--------cds_extractor.pl(26KB)
----seq_format-converter()
--------seq_format-converter.pl(3KB)
--------README.md(2KB)
----po2anno()
--------po2anno.pl(22KB)
--------README.md(6KB)
----rod_finder()
--------README.md(6KB)
--------blast_rod_finder.pl(21KB)
--------blast_rod_finder_legacy.sh(294B)
----calc_fastq-stats()
--------calc_fastq-stats.pl(17KB)
--------README.md(3KB)
----cdd2cog()
--------cdd2cog.pl(13KB)
--------README.md(5KB)
----rename_fasta_id()
--------README.md(3KB)
--------rename_fasta_id.pl(7KB)
----genomes_feature_table()
--------README.md(5KB)
--------genomes_feature_table.pl(18KB)