文件名称：biosuite:BioSuite是使用常见细菌基因组学工具的MATLAB函数的集合
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更新时间：2024-04-20 00:17:08
Python
生物套件 BioSuite是使用常见细菌基因组学工具的MATLAB函数的集合。 描述 严格的生物信息学管道通常需要集成多个工具，每个工具都依赖于具有复杂依赖性的不同语言。 对于具有一种（或更少）编程语言经验的学生和/或没有计算背景的更高级的科学家而言，这些障碍极具挑战性。 BioSuite是许多使用最广泛的细菌基因组学工具的汇编，包括全基因组比对，从头组装，SNP调用和功能注释/分析。 MATLAB包装器为后端源代码提供了一个简单的接口，并利用独立的conda环境来避免依赖冲突。 更高级的用户可以轻松地遵循模板来集成未包含的其他工具。 入门 依存关系 conda 码头工人 所有工具均已在Mac OSX 10.15.5和MATLAB R2019b上进行了测试 正在安装 先决条件 Conda ：请访问下载Conda。 滚动到底部，然后为您的操作系统选择命令行或图形安装程序（两者均应为Pytho