文件名称：genomics-scripts:使用基因组学工具和数据的脚本
文件大小：24KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-05 00:59:39
Python
基因组学脚本 用于处理基因组学工具和数据的脚本。
【文件预览】：
genomics-scripts-master
----sambam()
--------compute_bam_coverage.sh(578B)
--------bam_to_chrom_len.sh(376B)
--------generate_bam_coverage_over_bed.sh(975B)
----vcf()
--------shared_settings.sh(518B)
--------find_somatic.sh(4KB)
--------annotate_gemini_db.sh(671B)
--------sweep_and_compare_vcfs.sh(1KB)
--------bgzip_and_tabix.sh(452B)
--------find_somatic_with_gemini_parallel.sh(2KB)
--------replicates()
--------annotate.sh(668B)
--------gemini_operations.py(12KB)
--------create_docm_subsets.sh(900B)
--------find_somatic_with_gemini.sh(2KB)
----install()
--------install_snpeff.sh(519B)
--------install_gemini.sh(558B)
----annovar()
--------table_annovar.sh(372B)
--------vcf_to_annovar.sh(173B)
--------docm_to_annovar.sh(507B)
--------maf_to_annovar.sh(453B)
--------install_dbs.py(2KB)
----bed()
--------primers_to_target_regions.py(1KB)
----maf()
--------maf_to_vcf.sh(471B)
--------intersect_maf_and_bed.sh(469B)
----README.md(85B)
----pipelines()
--------create_gemini_db.sh(1KB)