superSTR:轻巧,无需比对的工具,可用于检测短读WGS,WES和RNA-seq数据中包含重复的读物

时间:2024-04-24 10:19:37
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文件名称:superSTR:轻巧,无需比对的工具,可用于检测短读WGS,WES和RNA-seq数据中包含重复的读物

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更新时间:2024-04-24 10:19:37

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超STR 当前正在将superSTR加载到此仓库中; 将会经常提供一些更新和新文档。 轻巧,无需比对的实用程序,可用于检测短读WGS,WES和RNA序列数据中包含重复的读段。 正在准备描述superSTR的预印本。 superSTR的C99组件是Roman Kolpakov,Ghizlane Bana和Gregory 修改和扩展的 。 有关mrep的完整详细信息,请参见及其随附的论文。 R.Kolpakov,G.Bana和G.Kucherov,mreps:DNA中串联重复序列的高效灵活检测,《核酸研究》(Nucleic Acid Research),31(13),2003年7月1日,第3672-3678页。 可以在找到superSTR中使用的库的完整详细信息。 基本的superSTR操作 本节介绍如何对人类基因组样本进行最少的麻烦的基本superSTR分析。 扩展和高级superS


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