文件名称：spladder:用于检测和定量RNA-Seq数据中可变剪接事件的工具
文件大小：5.11MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-05 05:33:31
Python
什么是SplAdder？ 本自述文件介绍了SplAdder软件，它是Splicing Adder的缩写，SplAdder是基于RNA-Seq比对数据进行选择性剪接分析的工具箱。 简而言之，该软件以标准格式获取给定的批注和RNA-Seq读取比对，将批注转换为剪接图表示形式，使用从读取的数据中提取的其他信息来增强剪接图，从图上提取替代剪接事件并量化基于对齐数据的事件。 然后可以将量化的事件用于差异分析。 依赖关系和安装 SplAdder依赖于Python3，仅需要很少的标准软件包。 依赖关系的完整列表可以在找到 我们建议使用python包管理器（例如anaconda）来组织依赖关系。 通过安装pip ： pip install spladder 从源安装： 克隆此存储库 在SplAdder根目录中，运行make install 文献资料 本自述文件仅提供基本SplAdder运行的高级概