文件名称：ClinQC:ClinQC：Sanger 和 NGS 临床数据质量控制工具-开源
文件大小：266.42MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-18 21:21:09
开源软件
ClinQC 是一个集成且用户友好的管道，用于在临床研究的单次运行中对数百至数千个样本/患者的 Sanger 和 NGS 测序数据进行质量控制、过滤和修整。 它可以分析原始测序数据并以 Sanger 质量编码为每个样本/患者生成统一的 FASTQ 文件输出。 首先，ClinQC 将输入读取文件从其原始格式转换为常见的 FASTQ 格式并移除适配器和 PCR 引物。 接下来，它拆分条形码样本、过滤重复项、污染和低质量序列并生成 QC 报告。