FASTQuick:超快速NGS数据质量控制工具

时间:2024-05-31 00:19:40
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文件名称:FASTQuick:超快速NGS数据质量控制工具

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更新时间:2024-05-31 00:19:40

quality-control pipeline fastq-format C++

概述 FASTQuick是用于NGS测序fastq文件的超快速QC工具。 它生成全面的质量控制统计信息列表,包括血统和污染估算,其周转时间比基于对齐的质量控制工具快约50倍。 引文 Zhang Fan,Hyun Min Kang,FASTQuick:快速而全面的原始序列读码质量评估,GigaScience,第10卷,第2期,2021年2月,giab004, //doi.org/10.1093/gigascience/giab004 内容 安装 要安装FASTQuick,请运行以下一系列命令。 git clone https://github.com/Griffan/FASTQuick.git cd FASTQuick mkdir build cd build cmake .. make make test 如果任何测试失败,请参阅Testing / Temporary / La


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