文件名称：BCP:NGS分析工具-开源
文件大小：1021KB
文件格式：GZ
更新时间：2024-06-16 08:39:52
开源软件
BCP是一种命令行工具，旨在分析NGS数据，还为某些常见的NGS软件提供包装，包括Fastx和Samtools。 它主要针对有针对性的重测序实验，具有用于一般用途的一组功能。 BCP还基于临床和基因组数据，基于盖尔模型，提供了乳腺癌风险评估功能。
【文件预览】：
BCP
----checkup.sh(194B)
----docs()
--------simulate.txt(876B)
--------call.txt(981B)
--------view.txt(498B)
--------clean.txt(740B)
--------convert.txt(1KB)
--------clip.txt(1KB)
--------stat.txt(717B)
--------run.txt(2KB)
--------index_fastq.txt(275B)
--------pileup.txt(691B)
--------align.txt(1KB)
--------index.txt(739B)
--------risk.txt(323B)
--------intersect.txt(454B)
----test()
--------GenomicData.csv(2KB)
--------test_sim.fastq(2.74MB)
--------ref.fasta(84KB)
--------ClinicalData.csv(1KB)
----bcpx.py(3KB)
----bcp_stats.py(5KB)
----boxPlot.R(1KB)
----ntDistr.R(1KB)
----xtab.py(1KB)
----README(10KB)
----bcp.py(17KB)
----bcRisk.R(18KB)
----lenDistr.R(319B)
----bcp_clean.py(13KB)
----COPYING(34KB)
----covDistr.R(310B)