miRBond:miRBond:miRNA-mRNA 和 miRNA-lncRNA 的基因组规模鉴定-开源

时间:2024-07-18 13:43:33
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文件名称:miRBond:miRBond:miRNA-mRNA 和 miRNA-lncRNA 的基因组规模鉴定-开源

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更新时间:2024-07-18 13:43:33

开源软件

家畜显示出相当大的遗传多样性。 以前的研究表明,动物表型受 miRNA-mRNA 相互作用的影响,但这些研究主要集中在分析一种或几种 miRNA-mRNA 相互作用上。 而在本研究中,我们通过使用 miRanda 和 TargetScan 算法在基因组规模上呈现 miRNA-mRNA 和 miRNA-lncRNA 相互作用。 在动物驯化过程中进行了强烈的定向人工选择。 因此,我们研究了位于 miRNA 和 miRNA 结合位点的 SNP,发现位于 mRNA 3'-UTR 的几个 SNP 有可能干扰 miRNA-mRNA 相互作用。


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