GDotplotter:探索基因组内和基因组之间的基因组同源性-开源

时间:2021-07-05 16:12:43
【文件属性】:
文件名称:GDotplotter:探索基因组内和基因组之间的基因组同源性-开源
文件大小:48.33MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-07-05 16:12:43
开源软件 基因组之间或每个基因组内的同源基因点图被证明是检测基因组结构变化的宝贵工具。 在这里,我们开发了 GDotplotter 来生成基因组点图,它在输入数据类型和输出数字方面都具有灵活性。 它还可以用于比较不同的软件来推断基因共线性。
【文件预览】:
GDotplotter.Perl.Script
----Arial.ttf(755KB)
----blast2dotplot-cdsvschr.pl(8KB)
----colinearscan2dotplot.pl(10KB)
----blast2dotplot.pl(10KB)
----colinearscan2dotplot-genevschr.pl(8KB)
----mcscan2dotplot.pl(10KB)
----adhore2dotplot.pl(10KB)
----comparedotplot.pl(15KB)
example
----Os_Sb.blk.rr(1.96MB)
----Arial.ttf(755KB)
----os_sb.mcscan.aligns(4.38MB)
----sb.newid.gff(1.07MB)
----os.newid.gff(1.28MB)
----sb_cds.os_chr.newid.blast(23.68MB)
----anchorpoints.txt(914KB)
----run.example.sh(1KB)
----os.chr.gff(315B)
----os_sb.newid.blast(125.37MB)

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