asgart:基因组规模，快速和精确的片段重复作图工具

【文件属性】：
文件名称：asgart:基因组规模，快速和精确的片段重复作图工具
文件大小：884KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-21 10:53:45
Rust ASGART：大型重复查找器 高效的工具，旨在在一个或多个DNA序列中搜索大（> 1000bp）重复，直至基因组规模。 发牌 Asgart是根据GPLv3许可发行的。 请参阅许可文件。 为什么要使用ASGART？ 您应在以下情况下使用ASGART： 您想在一个或多个DNA序列中找到片段重复； 您想在序列之间找到高度相似的部分，直至基因组规模； 您想在基因组之间绘制高度相似的序列； 您需要一种简单的方法来可视化结果。 安装 Linux Linux的静态二进制文件在用于x86_64平台。 苹果系统 macOS的二进制文件可。 从来源 要从源代码构建ASGART，您需要CMake，C编译器和。 满足这些要求后，克隆存储库及其子模块 git clone https://github.com/delehef/asgart.git cd asgart git submodule ini

【文件预览】：
asgart-master
----.gitignore(43B)
----libdivsufsort()
----src()
--------utils.rs(1KB)
--------divsufsort.rs(2KB)
--------bin()
--------logger.rs(2KB)
--------automaton.rs(6KB)
--------plot()
--------structs.rs(16KB)
--------exporters.rs(4KB)
--------searcher.rs(6KB)
--------lib.rs(151B)
----screenshots()
--------chord.png(646KB)
--------flat.png(141KB)
--------genome.png(13KB)
--------rosary.png(24KB)
----Cargo.toml(924B)
----LICENSE.txt(34KB)
----.gitmodules(98B)
----README.md(18KB)
----rustfmt.toml(240B)
----shell.nix(112B)
----build.rs(478B)