【文件属性】:
文件名称:bam-js:在javascript中为节点和浏览器解析BAM和BAM索引文件
文件大小:36.24MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-01 02:41:37
JavaScript
安装
$ npm install --save @gmod/bam
用法
const { BamFile } = require ( '@gmod/bam' ) // or import {BamFile} from '@gmod/bam'
const t = new BamFile ( {
bamPath : 'test.bam' ,
} )
var header = await t . getHeader ( )
// this would get same records as samtools view ctgA:1-50000
var records = await t . getRecordsForRange ( 'ctgA' , 0 , 49999 )
输入是从0开始的半开坐标(注意:与samtools视图坐标输入不同!)
htsget的用法
从1.0.41开始,我们支