文件名称:bam-js:在javascript中为节点和浏览器解析BAM和BAM索引文件
文件大小:36.24MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-20 20:28:17
JavaScript
安装 $ npm install --save @gmod/bam 用法 const { BamFile } = require ( '@gmod/bam' ) // or import {BamFile} from '@gmod/bam' const t = new BamFile ( { bamPath : 'test.bam' , } ) var header = await t . getHeader ( ) // this would get same records as samtools view ctgA:1-50000 var records = await t . getRecordsForRange ( 'ctgA' , 0 , 49999 ) 输入是从0开始的半开坐标(注意:与samtools视图坐标输入不同!) htsget的用法 从1.0.41开始,我们支