bai-indexer:为您的 BAM 索引 (BAI) 建立索引

【文件属性】：
文件名称：bai-indexer:为您的 BAM 索引 (BAI) 建立索引
文件大小：10KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-06-12 16:48:35
Python bai-indexer 为您的 BAM 索引 (BAI) 构建索引。 背景 是一种常见的文件格式，用于存储来自基因测序机的对齐读数。 这些文件可能会变得很大（100+ GB），因此拥有一个支持快速查找的索引会很有帮助。 为 BAM 索引定义了一种文件格式，并提供了一个生成索引的简单命令： samtools index file.bam file.bam.bai 不幸的是，这些 BAM 索引 (BAI) 文件也会变得非常大，通常会达到 10 MB 或更多。 使用或等基因组浏览器时，通过慢速网络加载大型 BAI 文件是显示对齐轨迹不可避免的第一步。 bai-indexer 通过建立你的 BAM 索引的索引来解决这个问题。 这是一个小的 JSON 文件，它将参考 ID（即染色体编号）映射到 BAI 文件中的字节范围。 通过加载 BAM 索引，查看器只能加载它实际需要的 BAM 索引的小

【文件预览】：
bai-indexer-master
----bai_indexer()
--------__init__.py(4KB)
----requirements.txt(5B)
----.travis.yml(97B)
----LICENSE(11KB)
----setup.py(986B)
----README.md(2KB)
----tests()
--------test_input_1_c.bam.bai(176B)
--------test_input_1_b.bam.bai(192B)
--------test_input_1_a.bam.bai(264B)
--------bai_indexer_test.py(933B)
----.gitignore(675B)