文件名称：snpsettest：使用GWAS摘要统计信息的基于集合的关联测试
文件大小：832KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-19 02:37:48
R
snpsettest snpsettest的目标是提供使用GWAS摘要统计信息执行基于集合的关联测试（例如，基于基因的关联测试）的简单工具。 该软件包目前正在开发中。 在snpsettest包A基于集合的关联检验是基于描述的统计测试 （VE rsatile克烯基于ssociation小号tudy），它结合了一组SNP占标志之间的连锁不平衡的效应。 与原始的VEGAS实现相比，此软件包使用了一种更有效的方法来计算集级别的p值，从而显着减少了计算时间。 安装 要安装此软件包， devtools :: install_github( " HimesGroup/snpsettest " ) 入门 这是一个基本示例，向您展示如何使用GWAS摘要统计信息执行基于基因的关联测试，在该统计信息中，SNP集由基因定义。 GWAS摘要文件 snpsettest软件包需要SNP级别的p值来执行基于基因的关
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snpsettest-main
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----vignettes()
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----DESCRIPTION(1KB)