文件名称：SummaryAUC:仅基于GWAS摘要统计信息计算AUC
文件大小：2.57MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-29 16:54:32
R
总结AUC 输入 prs.model.file，一个三列txt文件，“ rsID”，“ Effective_Allele”和“ BETA”，不需要标题。 gwas.summary.stats.file，GWAS摘要统计文件，带有“ CHR”，“ SNP”，“ A1”（有效等位基因），“ MAF”，“ BETA”或“ OR”，“ P”和“ INFO”（插补R平方得分，如果是基因分型，则设置为1；此列是可选的），标头是必需的。 N0，控件数。 N1，案件数。 soFile，“ getAdjCorrelation.so”，可以通过命令行中的“ R CMD SHLIB getAdjCorrelation.c”进行编译 KG.plink.pre，1000个基因组plink格式文件pre。 可在 下载1000个基因组plink文件。 pos_thr，SNP距离的阈值，将计算该距离内的任何SN
【文件预览】：
SummaryAUC-master
----MGS_0.5_1.0_CHR.SNP.A1.MAF.BETA.P.txt.gz(4KB)
----.gitignore(581B)
----README.md(2KB)
----LICENSE(34KB)
----.gitattributes(66B)
----auc.R(7KB)
----demo.png(395KB)
----ms.06062018.pdf(2.43MB)
----prs.model(4KB)
----getAdjCorrelation.c(6KB)