【文件属性】:
文件名称:bracer:BraCeR-从单细胞RNAseq数据重建B细胞受体序列
文件大小:67.86MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-22 20:05:12
Python
BraCeR
BraCeR-从单细胞RNA-seq数据重建B细胞受体序列。
重要说明:Python依赖项与TraCeR不同。 使用需求文件(详细介绍)来更新它们。
内容
介绍
该工具可从单细胞RNA-seq数据重建重排和表达的B细胞受体基因的序列。 然后,它使用BCR序列来识别源自相同原始克隆扩展细胞的细胞。 有关BraCeR的更多信息,请参见《的或之前的《 。
BraCeR建立在经过验证的工具上,可根据单细胞RNA序列数据(TraCeR)重建T细胞受体序列。 有关TraCeR,其验证以及如何将其用于研究感染期间T细胞种群的更多信息,请参阅《的论文或它之前的bioRxiv预印本。
请通过电子邮件将问题发送至ida.lindeman@medisin.uio.no
安装
BraCeR是用Python编写的,因此可以直接下载,设置为可执行文件(使用chmod u+x bracer )