文件名称：methpipe:用于从亚硫酸氢盐测序中分析DNA甲基化数据的管道
文件大小：723KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-24 10:25:43
C++
MethPipe软件包是用于分析亚硫酸氢盐测序数据（WGBS和RRBS）的计算管道。 MethPipe提供了对测序数据进行甲基化特定技术评估的工具，并用于估计各个胞嘧啶的甲基化水平。 此外，MethPipe包括用于识别更高级别甲基化功能的工具，例如低甲基化区域（HMR），部分甲基化域（PMD），高甲基化区域（HyperMR）和等位基因特异性甲基化区域（AMR）。 4.1.1版 此版本应比4.0.0稳定，并且应更易于构建和安装。 安装4.1.1版 所需的库 GNU科学图书馆：这一直是必需的。 它可以在Linux上使用apt进行安装，在macOS上使用brew进行安装，也可以从提供的源中进行安装。 Zlib压缩库。 您很可能已经在系统上安装了此程序。 如果没有安装，则可以通过软件包zlib1g-dev在apt上使用apt进行安装。 在macOS上，Zlib可以与brew一起安装。 可选：H