文件名称：AmpliMethProfiler:亚硫酸氢盐测序扩增子的CpG甲基化分析-开源
文件大小：138KB
文件格式：GZ
更新时间：2024-06-16 04:33:48
开源软件
ampliMethProfiler工具提供了一种简便且用户友好的方法，可以从目标亚硫酸氢盐测序实验中提取和分析读码的表位型组成。 具体而言，ampliMethProfiler提供了一种简便且用户友好的方法，可以从目标亚硫酸氢盐测序实验中提取和分析读数的等位基因组成。 ampliMethProfiler用python语言编写，并且需要在本地安装BLAST和QIIME工具。 它可以在Linux和OS X平台上运行。 如何引用我们：“ ampliMethProfiler：用于分析目标深亚硫酸氢盐测序扩增子的CpG甲基化图谱的管道”。 Scala G.等。 BMC生物信息学（2016）17：484，DOI：10.1186 / s12859-016-1380-3
【文件预览】：
._AmpliMethProfiler
AmpliMethProfiler
----ampliMethProfiler.py(9KB)
----._qiime_analysis.py(299B)
----._methylUtils.py(299B)
----._preprocessFasta.py(299B)
----qiime_analysis.py(3KB)
----methylUtils.py(30KB)
----._README.txt(299B)
----._AmpliMethProfiler_pipeline_help.doc(298B)
----AmpliMethProfiler_pipeline_help.doc(194KB)
----README.txt(6KB)
----._methProfiles.py(299B)
----._ampliMethProfiler.py(299B)
----methProfiles.py(5KB)
----preprocessFasta.py(2KB)