文件名称:meffil:用于分析DNA甲基化数据的高效算法
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更新时间:2024-05-23 22:19:23
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美菲 Min JL,Hemani G,Davey Smith G,Relton C,Suderman 。 生物信息学。 2018年6月21日 用于分析使用Infinium HumanMethylation450或MethylationEPIC BeadChips生成的DNA甲基化数据的高效算法: 使用并行化对大型数据集进行功能归一化。 混合使用Infinium HumanMethylation450和MethylationEPIC BeadChips进行数据集的标准化。 在功能标准化过程中包括用户定义的固定效应和随机效应。 使用预定义和用户定义的参考数据集进行细胞计数估计。 使用预定义和用户定义的微阵列探针注释。 整个表观基因组关联研究(使用来自任何标准化管道的数据)。 拷贝数估计。 报告生成总结了所有步骤。 可以在找到手册 在目录中可以找到使用其中许多功能的示例。 安装