文件名称：methylKit:用于DNA甲基化分析的R包
文件大小：687KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-26 12:49:40
visualization methylation statistical-analysis genome-biology R
甲基试剂盒 建置状态 介绍 methylKit是一个软件包，用于DNA甲基化分析和高通量亚硫酸氢盐测序的注释。 该软件包旨在处理及其变体的测序数据，还可以处理靶标捕获方法，例如序列。 此外，methylKit可以处理从Tab-seq或oxBS-seq获得的5hmC的碱基对分辨率数据。 如果提供正确的输入格式，它也可以处理全基因组亚硫酸氢盐测序数据。 当前功能 覆盖率统计 甲基化统计 样本相关和聚类 差异甲基化分析 功能注释和访问器/强制功能 多种可视化选项 区域和平铺窗口分析 （几乎）适当的 直接从对齐文件中读取甲基化调用 批量效果控制 多线程支持（用于更快的差异甲基化计算） 从生物导体包装GenomicRanges对物体施加强制 从通用文本文件中读取甲基化百分比数据 保持最新 您可以订阅我们的googlegroups页面，以获取有关新版本和功能的最新信息（低频率，仅发布更新） 要提问