【文件属性】：
文件名称：methylKit:用于DNA甲基化分析的R包
文件大小：687KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-06 19:03:00
visualization methylation statistical-analysis genome-biology R
甲基试剂盒
建置状态
介绍
methylKit是一个软件包，用于DNA甲基化分析和高通量亚硫酸氢盐测序的注释。 该软件包旨在处理及其变体的测序数据，还可以处理靶标捕获方法，例如序列。 此外，methylKit可以处理从Tab-seq或oxBS-seq获得的5hmC的碱基对分辨率数据。 如果提供正确的输入格式，它也可以处理全基因组亚硫酸氢盐测序数据。
当前功能
覆盖率统计
甲基化统计
样本相关和聚类
差异甲基化分析
功能注释和访问器/强制功能
多种可视化选项
区域和平铺窗口分析
（几乎）适当的
直接从对齐文件中读取甲基化调用
批量效果控制
多线程支持（用于更快的差异甲基化计算）
从生物导体包装GenomicRanges对物体施加强制
从通用文本文件中读取甲基化百分比数据
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