【文件属性】：
文件名称：生物信息学工具：用于生物信息学和基因组学研究的有用算法和脚本的集合
文件大小：27KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-02-13 10:15:28
Python
生物信息学工具
为生物信息学和遗传学研究编写的有用算法和脚本的集合。
要求
Python 3.7以上
目录
结盟
为核苷酸和氨基酸序列找到最佳局部或全局比对的程序。
global_align.py
比对两个核苷酸序列的Needleman-Wunsch算法。
用法
global_align.py [fasta] -m [match] -s [mis] -d [indel]
必填参数
fasta：包含用于比对的序列数据的文件，用“>”表示
-m / --match：每次比赛的比对得分
-s / --mismatch：每次不匹配的罚款
-d / --indel：每次插入或删除的惩罚
可选参数
-a：输出对齐
global_align_aa.py
比对两个氨基酸序列的Needleman-Wunsch算法。 使用BLOSUM62评分矩阵评分。
用法
global_align_aa.py [
【文件预览】：
bioinformatics-tools-master
----.gitignore(2KB)
----hidden_markov_model()
--------hmm.py(11KB)
----rna_seqtools()
--------quality_control.py(3KB)
--------quantify_exp.py(2KB)
----alignment()
--------local_align.py(6KB)
--------global_align_aa.py(8KB)
--------local_align_aa.py(8KB)
--------global_align.py(6KB)
----pattern_matching()
--------aho-corasick.py(8KB)
----file_tools()
--------parse_fasta.py(1KB)
--------parse_fastq.py(2KB)
----README.md(9KB)
----seq_tools()
--------orf_finder.py(3KB)
--------dna_map.py(4KB)
--------gene_finder.py(6KB)