【文件属性】：
文件名称：BioTools:用于生物信息学分析的个人脚本和集合
文件大小：3KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-04-12 21:45:01
Python
生物工具
GTF.py
提供一个类，使您可以解析，重建仅由外显子组成的GTF或计算一些基本统计信息。
用法
从CLI
要仅从外显子重建完整的GTF（具有3个级别：基因，转录本和外显子），请使用以下命令，然后将重建的GTF打印到STDOUT
GTF.py format {gtf_path}
要计算您的GTF（仅包含外显子的GTF）中的基因，转录本和外显子的数量，请使用：
GTF.py stats {gtf_path}
从Python脚本
首先，导入GTF类。 此类提供了一种静态方法来解析您的文件：
您的GTF由3个级别的注释组成。 在这种情况下，请使用：
from GTF import GTF
for gene in GTF . parse ({ your GTF file }):
print ( gene )
您的GTF仅由外显子组成。 在这种情况下，请添加arg by
【文件预览】：
BioTools-main
----GTF.py(7KB)
----.gitignore(14B)
----README.md(2KB)