脚本:生物信息学分析脚本

时间:2024-03-02 20:39:53
【文件属性】:

文件名称:脚本:生物信息学分析脚本

文件大小:18KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-02 20:39:53

Python

生物信息学脚本 这是用于分析不同形式的生物信息学数据的脚本的集合。 要运行Python脚本,请确保将环境变量PYTHONPATH设置为该目录的根目录: export PYTHONPATH=/path/to/scripts 这是在脚本之间导入模块所必需的。


【文件预览】:
scripts-master
----utils()
--------__init__.py(79B)
--------read_fasta.py(2KB)
--------print_histogram.py(2KB)
----tigmint()
--------__init__.py(0B)
--------num_cuts.py(1KB)
----variants()
--------count_eff.py(5KB)
----gff()
--------gene_length_histogram.py(2KB)
----fasta()
--------multi_to_single.sh(257B)
--------__init__.py(1B)
--------get_complete_cds.py(1KB)
--------filter_eAED.py(4KB)
----__init__.py(0B)
----README.md(331B)
----reads()
--------read_lengths.py(3KB)
--------sequence_cov.py(2KB)
--------bx_mult_hist.py(2KB)
--------interleave_fastq.py(1KB)
--------__init__.py(0B)
--------filter_bx.py(14KB)
----misc()
--------summarize_gag.sh(345B)
--------summarize_busco.sh(548B)
--------to_jira.py(3KB)
----.gitignore(21B)

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