文件名称：pyfaidx, 高效的Pythonic 随机访问fasta子序列.zip
文件大小：103KB
文件格式：ZIP
更新时间：2022-10-08 02:10:29
开源
pyfaidx, 高效的Pythonic 随机访问fasta子序列 描述Samtools为indexed提供了一个函数"faidx"( FASTA索引)，它创建一个小平面索引文件，允许快速随机访问索引FASTA文件，同时加载文件中的最小文件数量。 这个 python MODU
【文件预览】：
pyfaidx-master
----setup.py(2KB)
----.gitignore(115B)
----.codecov.yml(52B)
----.travis.yml(2KB)
----MANIFEST.in(26B)
----CODE_OF_CONDUCT.md(3KB)
----LICENSE(2KB)
----pyfaidx()
--------__init__.py(46KB)
--------cli.py(16KB)
----setup.cfg(39B)
----scripts()
--------benchmark.py(9KB)
----README.rst(23KB)
----tests()
--------test_FastaRecord.py(6KB)
--------data()
--------test_sequence_class.py(1KB)
--------test_feature_sequence_as_raw.py(2KB)
--------test_Fasta_bgzip.py(11KB)
--------test_feature_indexing.py(15KB)
--------test_Fasta_integer_index.py(772B)
--------test_Fasta_synchronization.py(8KB)
--------test_FastaVariant.py(2KB)
--------test_feature_split_char.py(2KB)
--------test_faidx.py(2KB)
--------test_bio_seqio.py(2KB)
--------test_feature_bounds_check.py(6KB)
--------test_feature_default_seq.py(686B)
--------test_FastaRecord_iter.py(1KB)
--------test_feature_key_function.py(3KB)
--------test_feature_spliced_seq.py(2KB)
--------test_feature_read_ahead_buffer.py(2KB)
----appveyor.yml(1KB)
----ci()
--------appveyor()
----.coveragerc(290B)
----dev-requirements.txt(65B)
----tox.ini(792B)