thaplv:单倍体单倍型VCF的工具

时间:2024-05-29 17:55:51
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文件名称:thaplv:单倍体单倍型VCF的工具

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更新时间:2024-05-29 17:55:51

thaplv :用于单倍体/单倍型VCF的工具 用于单倍体/单倍型VCF的工具( thaplv )是用于分析以VCF格式存储的单倍型(或单倍体)数据的软件包(请参阅有关基因组学格式规范的更多信息。此工具包的主要目的包括一套高效且高效的工具包)。使用快速实现单倍型方法。 请注意,该项目尚处于早期开发阶段,因此无法保证当前阶段的维护。 要求 Java 8 吉特 (开发人员)Gradle 2.13或更高 建设thaplv 要构建thaplv ,请运行./gradlew shadowJar 。 打包的jar将位于build/libs/ ,名称为thaplv--all.jar 。 测试thaplv 要运行所有测试,请运行./gradlew test 。 测试报告将在build/reports/tests/index.html 要运行测试的子集,请使用gradle提供的 。


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