文件名称：starfish:与多个具有单倍型意识的VCF文件相交
文件大小：249KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-25 14:15:30
haplotypes intersection variant-calls compare-files vcf-files
海星 海星是使用功能强大的 vcfeval引擎比较和相交具有单倍型意识的多个VCF文件的工具。 “海星”这个名称来自程序可以绘制的维恩图的形状（带有5个VCF！）。 要求 Python3 [可选：用于绘制维恩图] 安装 git clone --recursive https://github.com/dancooke/starfish 用法 只有三个必需的选项： --sdf （short -t ）：RTG工具的SDF参考目录（使用rtg format ） --variants （short -V ）：要相交的VCF文件列表。 --output （short -O ）：写交集的目录路径。 例如： ./starfish \ -t reference.sdf \ -V vcf1.vcf.gz vcf2.vcf.gz vcf3.vcf.gz \ -O isec
【文件预览】：
starfish-master
----.gitignore(1KB)
----README.md(4KB)
----.gitmodules(83B)
----LICENSE(1KB)
----venn.png(255KB)
----starfish.py(18KB)
----pyvenn()